Toàn Chức Pháp Sư phần 6 chủ yếu xoay quanh cốt truyện Mạc Phàm quay về học viện, một mình khiêu chiến Hỏa Viện, sau đó vang danh khắp chốn. Trong phần này, Mạc Phàm vô tình được biết về “Viêm Cơ”, để tìm kiếm nó, Mạc Phàm, Tâm Hạ, Triệu Mãn Duyên và Trương Tiểu Hầu đã tập hợp lại, thành lập tiểu đội mạo hiểm, xuất phát đi thám hiểm Trác Nguyên Bắc Giác. Trên hành trình tìm kiếm trái Hoả Kiếp, tiểu đội gặp phải vô vàn khó khăn như phải chiến đấu với Bạch Sa Yêu Binh, nham thạch nóng chảy và vô số trận chiến sắp bùng nổ. Đối mặt với khó khăn, họ ngày càng trưởng thành hơn, thực lực của cả đội cũng ngày một tiến bộ hơn, và quan trọng hơn hết, tình cảm giữa họ đã khăng khít hơn rất nhiều.