Mục Thần Ký được coi là một cuộc phiêu lưu đầy những cuộc chinh phục mãn nhãn của anh chàng Tần Mục tại đế quốc Diên Khang của anh. Vốn là một con người có những thiên phú về khả năng tu luyện cũng như sức mạnh bạt núi cử đỉnh, nhưng cũng bởi vì anh mang thân phận của một giáo chủ ma giáo nên khả năng cũng bị hạn chế rất nhiều. Đến một ngày nọ, có lẽ cũng là do cơ duyên mà tác giả sắp đặt, Tần Mục đã trở thành một tiến sĩ thái học tại đất nước Diên Khang, nơi mà đang liên tiếp xảy ra những cuộc nổi loạn của nhiều thế lực. Cùng với Võ Khả Hán, Tần Mục đã không ngần ngại gian khó để dấn thân vào con đường chinh phạt, giành lại bình yên cho đất nước, nhận lấy truyền thừa để trong tương lai sẽ trở thành vị Nhân Hoàng tiếp theo, tiếp nối những ngày tháng huy hoàng của đế quốc Diên Khang.